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生物信息学常规技术培训班(暑期班•北京)

主办单位:北京华大基因研究中心
培训时间:8月24日 - 8月28日
培训地点:中国•北京
详情访问:http://www.genomics.org.cn

当辛辛苦苦拿到丰富的数据信息时
您为海量数据迷惑而苦于不知从何着手吗?
您面对众多的生物信息学分析软件而不知如何取舍吗?
……
来这里吧,
华大基因将帮你探索生命的奥秘。

这里有良师:

由经历国际人类基因组计划1%项目、HapMap 10%项目、水稻、家蚕、家鸡和熊猫基因组以及“炎黄一号”等大型项目分析的国际一流生物信息学专家为您讲解。


这里有益友:

志同道合的学友在深具个性魅力的华大教师团队带领下,形成浓厚的学习氛围,能为您开拓思路并提供专业的建议。


培训班的优势:

1. 理论课程和上机实践结合,为每位学员提供笔记本电脑上机设备,仅限前30名学员(以汇款顺序为准);

2. 从基本生物学问题出发,结合具体实例,实实在在的分析数据;

3. 灵活的“个性化”课程安排:当您因为出差、课时冲突等各种原因无法参加某一课时,我们会为您保留资格,您可以在我们全年的课程中选择自己合适的时间参加。


您将得到以下知识和技能充实自己:

1. 熟练掌握生物信息学各种常用软件的下载、安装及使用;

2. 具备独立分析基因组数据的能力,如组装、基因预测、功能注释、重复序列分析、SNP分析、进化相关分析等;

3. 熟悉常用公共数据库的内容及特点,能够快速的进行检索查询和数据下载;

4. 根据您实验室的具体情况, 我们还可以为您提供相应的软硬件分析解决方案,助您建立起自己的生物信息分析平台—BLC(Bioinformatics Linux Cluster)。


课程内容安排:
时间 课程内容 具体内容

   Day 1
(09:00-10:00)

生物信息学概论 生物信息学的发展历史、研究内容和方向简介

   Day 1
(10:00-12:00)

常用生物数据及数据库介绍 (1) 综合数据库:NCBI/UCSC/ENSEMBL
(2) 蛋白数据库:SWISSPROT/PDB
(3) 其他基因组数据库:Rice/Silkworm
(4) 常用生物信息数据格式:fasta/phylip…

   Day 1
(13:00-15:00)
(15:00-17:30)

Unix/Linux操作系统介绍 (1) Linux环境配置
(2) Unix/Linux基础知识及常用命令
(3) 上机实习

   Day 2
(09:00-12:00)
(13:00-17:30)

序列的比对 (1) 全局比对 Clustal W/Muscle/Hmmer
(2) 局部比对
Blast/Blat/Sim4/Genewise/soap/maq
(3) 上机练习

   Day 3
(09:00-12:00)
(13:00-17:30)

基因组/基因注释分析 (1) 重复序列分析
散布分布重复RepeatMasker,串联重复TRF
(2) RNA分析
tRNA/rRNA/microRNA/snoRNA
(3) 基因预测
原核:Glimmer
真核:Genescan/Fgenesh/BGF
(4) 基因功能注释
NT/NR/SwissProt/Kegg/COG
Interpro/GO
(6) 上机练习

   Day 4
(09:00-12:00)
(13:00-17:30)

测序技术、数据的基本处理及组装 (1) Sanger测序原理
(2) Sanger数据的基本处理流程
(3) Solexa测序技术及应用
(4) Solexa表达谱及转录组分析
(5) Solexa数据组装
(6) SOLiD和454的测序原理
(7) 上机练习

   Day 5
(09:00-10:30)
(10:30-12:00)

多态性分析 (1) 基于sanger重测序:Polyphred/consed
(2) 基于solexa查找SNP/SV
(3) 上机练习

   Day 5
(13:00-14:30)
(14:30-17:00)

分子进化分析 (1) Ka/Ks的计算:Kaks_calculator
(2) 分子进化树的构建: phylip/paml/mega
(3) 基因家族的寻找及构建进化树:FGF
(4) 上机练习

   Day 5
(17:00-17:30)

结业典礼 (1) 考核合格颁发结业证
(2) 拍集体照
 
最新培训资讯:8月17日-8月24日农大专题班

 


报名方式:


 本培训班注册费4000元(含讲课费、上机费、教材费)。可协助安排住宿,费用自理。

 培训报名:请填写报名表(完整正确填写将可能获得礼物一份):


姓名: 性别: 男 女
专业: 工作单位:
注:职务内容:专业技术职称或研究生
手机号码: 职务:
联系电话: 电子邮箱:
安排住宿: 是 否
信息渠道: 华大主页 Illumina 华大市场推广
朋友推荐 邮件宣传 丁香园 生物通
注意:下一行仅用于显示,不必填写。
备注:
验证码  看不清? 验证码:

 咨询电话:13651281331 王老师

 Email:training@genomics.org.cn
  通讯地址:北京空港工业区B区6号楼(101300)



热忱欢迎各位有识之士报名参加。名额有限,报名从速。

培训班照片01 培训班照片02 培训班照片03
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| 意见箱 | 联系电话:86-010-80485999 86-010-80485559